1766年,菲奥多毕业于海军少年团,前往波罗的海服役。他从1775年开始担任护卫舰舰长,1780年被任命为皇家游艇艇长,但很快放弃了御前生涯。
乌沙科夫于1798~1800年间指挥位于地中海的俄罗斯舰队。他是希腊七岛共和国宪法的起草者。1799年晋升为海军元帅。乌沙科夫于1807年退役,生活在位于阿列克谢耶夫卡村的自家庄园中。在庄园生活期间,他投身于宗教祷告和广泛的慈善活动中。
伟大的海军统帅菲奥多·乌沙科夫于1817年10月14日去世。
菲奥多·乌沙科夫被奉为俄罗斯海军舰队(从2000年起)和战略空军(从2005年起)的守护神。乌沙科夫的名字被授予一些海军战舰,其中把包括“乌沙科夫海军元帅”号核动力巡洋舰。