在此之前,琥珀从未被用作房屋内装饰。王室收藏的琥珀帮助他实现了这个独特的设计。在王室收藏中,还有三面使用华丽的琥珀装饰镜框的镜子。
1716年,腓特烈·威廉一世(Friedrich Wilhelm I)将琥珀屋作为外交礼物送给了彼得一世。但彼得在世时,琥珀屋一直没有安装好。彼得去世后,他的女儿叶丽萨维塔决定使用琥珀屋来装饰自己的官邸。
伟大卫国战争期间,由于材料易碎,琥珀屋和其他一些极为珍贵的古物未能转移到后方。人们把它封存起来,外面贴上纸、纱布和棉絮。然而侵略者将它运到了柯尼斯堡。
被盗走的琥珀墙壁和琥珀门安装在柯尼斯城堡的一个大厅中。它们成了当时所在的博物馆中最好的展品。德国人撤退时,将琥珀屋拆了下来并秘密运走。
寻找琥珀屋的工作几乎在攻克柯尼斯堡之后就立即开始了。这项工作持续了很多年,但琥珀屋却俨如石沉大海。
1997年,德国政府从一位公证员的手中没收了一块琥珀屋的残片。原来,这块残片是一名参加过从皇村盗运琥珀屋的德国军官交给该公证员保管的。2000年4月29日,德国将这块琥珀屋残片交还给俄罗斯。